شبیه سازی دینامیک مولکولی (MD) دانشی است که از ترکیب علوم زیستی، شیمی و روش ها و الگوریتم های متنوع رایانه ای ریاضیاتی استفاده می کند. این تکنیک جهت طراحی پیشرفته دارو، واکسن، آنتی بادی، پروتئین یا پپتید و سایر ماکرو و میکرو مولکول های بکار برده می شود. اسهال گوساله یکی از بیماریهای است که عوامل متعدد ویروسی، باکتریایی و انگلی در بروز آن نقش دارند. کروناویروس یکی از عوامل مهم در بروز این سندرم می باشد. از سال 1969 میلادی به بعد برای نشان دادن حضور ویروس در نمونه های مدفوع گوساله های مبتلا به اسهال استفاده از میکروسکوپ الکترونی به عنوان یکی از روش های تشخیصی مورد توجه قرار گرفت. در این مطالعه توالی اسیدآمینه پروتین کروناویروس گرفته شد و با استفاده از نرم افزارهای مختلف و با استفاده از نرم افزار Cluspro 2.0 داکینگ مولکولی بین کروناویروس وپیبتید لاکتوفرین شتری مهندسی شده انجام شد سپس در محیط لنوکس وبا استفاده از کرومکس مدل مورد نظر شبیه سازی انجام گردید. نتایج به دست آمده نشان داد که بیشترین طول پیوند5/2 وکمترین 7/1بود که این باعث می‌شود ارتباط بین دو پروتین قوی ومستحکم بود که ممکن است این ارتباط پایدار بودو به واقعیت نزدیک است. ومدل شبیه سازی که در محیط in silico می‌تواند درجهت اعمال درمانی هم برای طراحی داروها استفاده خواهد شد.

کلمات کلیدی