عنوان : ( تمایز ارقام مقاوم ملون در برابر قارچ Fusarium oxysporum f. sp. melonis بر اساس صفات ظاهری و الگوی حضور ژنهای مقاومت )
نویسندگان: فرهاد شکوهی فر , مجتبی ممرآبادی , صهبا طوسی ,
Full Textچکیده
دستیابی به نشانگرهای مرتبط به صفت مقاومت به بیماری پژمردگی فوزاریومی ملون میتواند در پیشبرد برنامههای ،Charentais Fom1 ،Charentais T اصلاحی موثر باشد. بدین منظور تعدادی از ارقام استاندارد ملون شامل Fusarium oxysporum f. sp. با سطوح مقاومتی مختلف در برابر قارچ BG- و 5384 Charentais Fom2 از نظر صفات ظاهری گیاه و همچنین الگوی حضور ژنهای مقاومت در برابر بیماریها مورد بررسی قرار ،melonis گرفتند. بر اساس نتایج بدست آمده هرچند امکان تمایز ارقام بر اساس صفات ظاهری ممکن بود ولی از آنجا که مطالعه این صفات در ارزیابی تعداد زیاد نمونهها در مطالعات گزینشی کاری بسیار زمانبر و هزینهبر است، الگوی حضور ژنهای مقاومت در دادههای ژنومی این ارقام مورد بررسی قرار گرفت. آنالیزهای دادههای ژنومی ملون با هدف مکانیابی موقعیت به عنوان یکی از گروه های لینکاژی حامل تعدادی از ژن های مقاومت انجام شد. توالی این MRGH گروه لینکاژی 21 ردیابی شد و توالی حدفاصل دو ژن MELONOMICS و پایگاه NCBI گروه لینکاژی از دو پایگاه بانک ژن در در برگیرنده این گروه لینکاژی )MELO3C000335.2.1( MRGH و 13 )MELO3C022143.2.1( MRGH12 استحصال شد. وجود جهشهای نقطه ای متعدد در دادههای ژنومی سبب شد تا توالی ژن Ch روی کروموزوم شماره 09 برای ردیابی بخشی PSh21-F/R جهت ردیابی در ارقام ملون مورد بررسی قرار گیرد. آغازگرهای اختصاصی MRGH13 BG- و 5384 Charentais Fom از توالی این ژن طراحی شد. نتایج ردیابی نشان داد تک باند اختصاصی در ارقام 1 با آنالیز توالی آن MRGH منطبق با اندازه مورد انتظار قابل ردیابی است. نقش احتمالی پروتئین کدشونده توسط ژن 13 این پروتئین را به عنوان یک عضو خانواده پروتئینهای حامل توالیهای تکراری غنی از InterPro در ابزار تحت شبکه را مشخص نمود. فرآیندهای زیستی مرتبط با پروتئین LRR و NB-ARC ،TIR لوسین تایید نمود و موقعیت دمینهای ارتباط آن را در مسیر پیامرسانی تنظیمکننده پاسخهای ایمنی نشان داد. QuickGO در ابزار تحت شبکه MRGH13 در تعداد بیشتری از MRGH در مطالعات آتی ارزیابی قابلیت تمایز ارقام مقاوم براساس ژنهای مقاومت از جمله ژن 13 بررسی MRGH نمونهها مورد بررسی پیشنهاد میگردد. همچنین با توجه به کارکردهای پیشبینیشده برای پروتئین 13 نحوه برهمکنش آن با دیگر پروتئینهای مقاومت و همچنین پروتئینهای عوامل بیماریزا میتواند در شناسایی نقش کارکردی آن در مقاومت مفید باشد.
کلمات کلیدی
, بیماری پژمردگی فوزاریومی ملون, ژنهای مقاومت حامل توالی های تکراری غنی از لوسین, داده های ژنومی ملون, گزینش مبتنی بر صفات مرتبط با مقاومت
@article{paperid:1099190,
author = {شکوهی فر, فرهاد and ممرآبادی, مجتبی and طوسی, صهبا},
title = {تمایز ارقام مقاوم ملون در برابر قارچ Fusarium oxysporum f. sp. melonis بر اساس صفات ظاهری و الگوی حضور ژنهای مقاومت},
journal = {علوم باغبانی},
year = {2024},
month = {June},
issn = {2423-3986},
keywords = {بیماری پژمردگی فوزاریومی ملون، ژنهای مقاومت حامل توالی های تکراری غنی از لوسین، داده های ژنومی ملون،
گزینش مبتنی بر صفات مرتبط با مقاومت},
}
%0 Journal Article
%T تمایز ارقام مقاوم ملون در برابر قارچ Fusarium oxysporum f. sp. melonis بر اساس صفات ظاهری و الگوی حضور ژنهای مقاومت
%A شکوهی فر, فرهاد
%A ممرآبادی, مجتبی
%A طوسی, صهبا
%J علوم باغبانی
%@ 2423-3986
%D 2024
