پژوهشهای علوم دامی ایران, دوره (7), شماره (2), سال (2015-9) , صفحات (191-198)

عنوان : ( برآورد اثر لایه بندی جمعیتی در گله های خویشاوند و آمیخته گاوهای شیری به روش شبیه سازی مطالعات ارتباطی کل ژنومی )

نویسندگان: مرتضی بیطرف ثانی , محمدرضا نصیری , علی اصغر اسلمی نژاد , محمد مهدی شریعتی ,

بر اساس تصمیم نویسنده مقاله دسترسی به متن کامل برای اعضای غیر دانشگاه ممکن نیست

استناددهی: BibTeX | EndNote

چکیده

لایه بندی جمعیتی یکی از مسائلی است که می تواند در مطالعات ارتباطی ژنومی باعث بروز خطا شود. در این تحقیق از شیوه مطالعه ارتباطی ژنومی ( طرح Case-Control) برای شناسایی اثر لایه بندی جمعیتی استفاده شد. جامعه آماری و ژنوم 10000 گاو در طی 100 نسل با روش تعادل رانش – جهش ژنتیکی شبیه سازی و سپس با استفاده از این جامعه، 800 گاو آمیخته و خالص با 50000 SNP ژنوتایپ شده، ایجاد شدند. نتایج نشان می دهد که هر چه نسبت تعداد Case/Control در بین جوامع خویشاوند از عدد یک بیشتر منحرف شود، شاخص آماری لامبدا که نشان دهنده اثر لایه بندی جمعیتی است، افزایش خواهد یافت به طوری که شاخص لامبدا در مدل ژنتیکی افزایشی با نسبت های 1، 77/0 و 33/0 به ترتیب 42/0 ، 31/11 و 77/97 و در مدل ژنتیکی عدم غلبه، به ترتیب 47/0 ، 21/8 و 40/57 برآورد گردید. اثر لایه بندی جمعیتی در بین گروههای مختلف جامعه گاوهای آمیخته وجود نداشت و شاخص لامبدا در مدلهای ژنتیکی عدم غلبه، غلبه کامل، مغلوبیت، افزایشی و فوق غلبه به ترتیب 55/0 ، 66/0 ، 89/0 ، 76/0 و 41/0 برآورد شد. نتایج این تحقیق نشان می دهد که برای کنترل اثر لایه بندی جمعیتی در مطالعات ارتباطی ژنومی، گروههای case-control نبایستی از جوامعی مختلف با اجداد و درجه خویشاوندی متفاوت انتخاب شوند مگر با نسبتهای کاملا یکنواخت در دو جامعه. همچنین پیشنهاد می گردد از گاوهای آمیخته به دلیل عدم وجود عامل ساختار ژنتیکی جمعیتی استفاده گردد.

کلمات کلیدی

, مطالعات ارتباطی , لایه بندی جمعیتی , اسنیپ
برای دانلود از شناسه و رمز عبور پرتال پویا استفاده کنید.

@article{paperid:1047711,
author = {بیطرف ثانی, مرتضی and نصیری, محمدرضا and اسلمی نژاد, علی اصغر and شریعتی, محمد مهدی},
title = {برآورد اثر لایه بندی جمعیتی در گله های خویشاوند و آمیخته گاوهای شیری به روش شبیه سازی مطالعات ارتباطی کل ژنومی},
journal = {پژوهشهای علوم دامی ایران},
year = {2015},
volume = {7},
number = {2},
month = {September},
issn = {2008-3106},
pages = {191--198},
numpages = {7},
keywords = {مطالعات ارتباطی ، لایه بندی جمعیتی ،اسنیپ},
}

[Download]

%0 Journal Article
%T برآورد اثر لایه بندی جمعیتی در گله های خویشاوند و آمیخته گاوهای شیری به روش شبیه سازی مطالعات ارتباطی کل ژنومی
%A بیطرف ثانی, مرتضی
%A نصیری, محمدرضا
%A اسلمی نژاد, علی اصغر
%A شریعتی, محمد مهدی
%J پژوهشهای علوم دامی ایران
%@ 2008-3106
%D 2015

[Download]