یکی از بیمارگرهای بسیار مهم و خسارتزا در مناطق کشت ذرت و نیشکر در دنیا (Sugarcane mosaic virus; SCMV) ویروس موزائیک نیشکر 1392 تعداد 45 نمونه مشکوک به آلودگی از مزارع نیشکر و ذرت در استان مازندران - است. به منظور ردیابی و شناسایی این ویروس، در سالهای 1393 با استفاده از یک جفت آغازگر (Reverse transcription-PCR, RT-PCR) جمعآوری شد. در واکنش زنجیرهای پلیمراز با نسخهبرداری معکوس مربوط به چهار جدایه پس از PCR اختصاصی مربوط به ژن پروتئین پوششی، قطعهای به طول 900 جفت باز در 35 نمونه تکثیر گردید. محصول توالییابی شده و با سایر توالیهای موجود در بانک ژن مقایسه گردید. در آنالیز فیلوژنتیکی، توالی نوکلئوتیدی 36 ،pTG19-T همسانهسازی در ناقل و چهار زیر گروه قرار گرفتند و جدایههای مازندران نیز در کنار جدایه های خوزستان و مصر در (II و I ) جدایه ویروس موزائیک نیشکر در دو گروه قرار گرفتند. آنالیز فیلوژنتیکی جدایههای تعیین توالی شده در ناحیه ژنی پروتئین پوششی نشان داد که چهار جدایه مازندران با سایر IA زیرگروه 97 تا / از مصر (بین 6 EGY7- جدایه های ویروس موزائیک نیشکر بین 78 تا 99 % در سطح نوکلئوتیدی مشابهت دارند که بیشترین شباهت با جدایه 1 (% 78/ از چین (بین 78 تا 8 BD 98 %) و کمترین شباهت با جدایه 8 / 96 تا 8 / از خوزستان در ایران (بین 6 khzL و 66 khzQ 99 %) و جدایههای 86 99 % تعیین گردید. این اولین /3- 97 و 100 -98/ میباشد. همچنین تشابه توالی نوکلئوتیدی و آمینواسیدی این چهار جدایه با یکدیگر به ترتیب بین 9 در استان مازندران براساس ژن پروتئین پوششی است.

کلمات کلیدی