عنوان : ( شناسایی مولکولی استرین C ویروس وای سیب زمینی (Potato virus Y) از گوجه فرنگی در استان مازندران )
نویسندگان: زهره مرادی , محسن مهرور , احسان نظیفی ,بر اساس تصمیم نویسنده مقاله دسترسی به متن کامل برای اعضای غیر دانشگاه ممکن نیست
چکیده
ویروس وای سیبزمینی (Potato virus Y, PVY) عضو تیپ جنس Potyvirus، یکی از مهمترین عوامل بیمارگر در گیاهان خانواده سولاناسه میباشد. در سال زراعی 1392 تعداد 38 نمونه مشکوک به آلودگی ویروسی از مزارع گوجهفرنگی استان مازندران جمعآوری و پس از بررسی با آغازگرهای دژنره پوتیویروسها، تعداد 9 نمونه آلوده به پوتیویروس تشخیص داده شدند. پس از همسانهسازی و توالییابی نمونههای آلوده، چهار جدایه با علائم موزائیک، پیسکی و بدشکلی به عنوان PVY شناخته شدند که به دلیل شباهت بالا، دو جدایه به نامهای GB و GRA انتخاب گردید. آنالیز فیلوژنتیکی جدایههای ایرانی به همراه 115 جدایه دیگر موجود در بانک ژن در ناحیه ژنی CI (Cylindrical inclusion) نشان داد که تمام جدایههای مقایسه شده در سه گروه اصلی (I، II، III) قرار گرفته و جدایههای ایرانی همراه با جدایههایی از کشورهای ایتالیا، استرالیا، هلند، فرانسه، اسپانیا و اروگوئه که همگی از نژادC میباشند در زیر گروه IF قرار میگیرند. جدایههای ایرانی PVY-GB و -GRA در زیرگروه IF یکsublineage جداگانه را تشکیل دادند و دارای بیشترین شباهت (5/96-7/95 درصد) با جدایه اسپانیا (LYE84.2) و کمترین شباهت (3/81-9/80 درصد) با جدایه ژاپن (T13) و کانادا (Tu_660) در سطح نوکلئوتیدی بودند. در سطح آمینواسیدی نیز جدایههای ایرانی بیشترین شباهت (1/99 درصد) را با جدایه اسپانیا (LYE84.2)، ایتالیا (Foggia) و اروگوئه (Tannat) و کمترین شباهت (4/93 درصد) را با جدایه ژاپن (T13) داشتند. همچنین تشابه توالی نوکلئوتیدی و آمینواسیدی این دو جدایه با یکدیگر به ترتیب 4/98 و 100 درصد تعیین گردید. این اولین گزارش از وجود نژاد PVYC از گیاه گوجهفرنگی در استان مازندران و ایران میباشد.
کلمات کلیدی
, آنالیز فیلوژنتیکی, ایران, ژن CI, پوتی¬ویروس@article{paperid:1072666,
author = {مرادی, زهره and مهرور, محسن and احسان نظیفی},
title = {شناسایی مولکولی استرین C ویروس وای سیب زمینی (Potato virus Y) از گوجه فرنگی در استان مازندران},
journal = {پژوهش های حفاظت گیاهان ایران},
year = {2018},
volume = {32},
number = {3},
month = {December},
issn = {2980-8170},
pages = {315--322},
numpages = {7},
keywords = {آنالیز فیلوژنتیکی; ایران; ژن CI; پوتی¬ویروس},
}
%0 Journal Article
%T شناسایی مولکولی استرین C ویروس وای سیب زمینی (Potato virus Y) از گوجه فرنگی در استان مازندران
%A مرادی, زهره
%A مهرور, محسن
%A احسان نظیفی
%J پژوهش های حفاظت گیاهان ایران
%@ 2980-8170
%D 2018