ویروئید پنج مرکبات 24 نوکلئوتید طول دارند نقش مهمی در تنظیم - دارد و یکی از ویروئیدهای بیماریزا در مرکبات است. آر اِن اِ های کوچک که 20 دو ،CVdV فرایندهای بیولوژیکی و متابولیکی گیاهان ایفا میکنند. برای شناسایی آر اِن اِ های کوچک تولید شده در پاسخ به آلودگی به روش CVdV سالم و آلوده به -Solanum lycopersicum- کتابخانه از آر اِن اِ های کوچک استخراج شده از گیاهان گوجه فرنگی توالی Illumina Hi-Seq ساخته شد و در پلت فرم 2500 -Capture and Amplification by Tailing and Switching- CATS یابی شدند. پس از حذف آداپتورها و خوانشهای با کیفیت پایین، خوانشهای پالایش شده با ژنوم ویروئید و ژنوم مرجع گوجه فرنگی انجام شد. plantgrn همردیف سازی شدند. شناسایی ام آر اِن اِ هدف هر میکرو آر اِن اِ و نقش آنها با استفاده از تارنمای -SL2.0.50.- انجام شد. آنالیز نتایج نشان داد که در مجموع 28 میکرو آر اِن اِ miRbase شناسایی میکرو آر اِن اِ ها با استفاده از پایگاه اطلاعات نقش داشتند. این آر اِن اِ های کوچک شناسایی شده، 188 ژن را در CVdV محافظت شده و 13 میکرو آر اِن اِ جدید در پاسخ به آلودگی رونوشتهای گوجه فرنگی هدف قرار میدهند که این ژنها در تنظیم فرایندهای بیوسنتزی، متابولیسم ترکیبات سلولی، کاتابولیسم، تنظیم رونویسی، پاسخ به تنشهای زنده و غیر زنده، پاسخهای هورمونی، انتقال سیگنال و بعضی دیگر از فعالیت سلولی نقش دارند. همچنین آر اِن اِ های کوچک شناسایی شده در مسیرهای بیوسنتز فلاونوئید، فنیل پروپانوئید و اسید لینولنیک ایجاد اختلال میکنند که منجر به مختل با تنظیم فعالیت CVdV شدن واکنشهای دفاعی گیاه میشود. از سوی دیگر آر اِن اِهای کوچک تولید شده در پاسخ به آلودگی فاکتورهای رونویسی، پروتئینهای سیگنال -به خصوص سرین- ترئونین کینیازها- و پروتئینهای سیگنالدهی اکسین موجب تغییر در متابولیسم و رشد و نمو گیاه شده و شرایط مناسب برای ایجاد بیماری را در گیاه را فراهم میکنند.

Keywords