عنوان : ( Study of camel lactoferrin derive peptide and DNA interaction using molecular dynamic simulation )
نویسندگان: سید زانا پیرخضرانیان , محمدهادی سخاوتی , مجتبی طهمورث پور , چاویر دورا , حسن منهمی ,
دانلود فایل برای اعضای دانشگاهبر اساس تصمیم نویسنده مقاله دسترسی به متن کامل برای اعضای غیر دانشگاه ممکن نیست
چکیده
Nowadays antimicrobial peptides are the most important alternative to antibiotics. However the mechanism of the AMPs is not completely understood. In our previous studies, CLF36 as a chimeric derived peptide from camel lactoferrin showed a broad spectrum antimicrobial activity against both Gram-negative and Gram-positive bacteria. To predict the mechanism of this peptide, we investigated the interaction between CLF36 and DNA as one of the intra-cellular target for AMPs. The complex was studied using Gromacs 2016.1 package with CHRMM27 force field. The system was solvated using SPC water model in 200ns. The RMSD andg the breaing of the hydrogen bonds between the two strands of DNA
کلمات کلیدی
, Molecular dynamics simulation; DNA; AMPs, Camel lactoferrin
@inproceedings{paperid:1078265,
author = {پیرخضرانیان, سید زانا and سخاوتی, محمدهادی and طهمورث پور, مجتبی and چاویر دورا and حسن منهمی},
title = {Study of camel lactoferrin derive peptide and DNA interaction using molecular dynamic simulation},
booktitle = {چهارمین کنفرانس علوم پروتئین و پپتید},
year = {2019},
location = {اصفهان, ايران},
keywords = {Molecular dynamics simulation; DNA; AMPs; Camel lactoferrin},
}
%0 Conference Proceedings
%T Study of camel lactoferrin derive peptide and DNA interaction using molecular dynamic simulation
%A پیرخضرانیان, سید زانا
%A سخاوتی, محمدهادی
%A طهمورث پور, مجتبی
%A چاویر دورا
%A حسن منهمی
%J چهارمین کنفرانس علوم پروتئین و پپتید
%D 2019
