زیست فناوری گیاهان زراعی, دوره (10), شماره (4), سال (2022-4) , صفحات (37-46)

عنوان : ( شناسایی ژ نهای دخیل در استقرار رابطه انگلی در گ لجالیز مصری بر پایه تجزیه و تحلیل دادههای بیان ژ ن )

نویسندگان: راحیل دولت ابادی , هاجر شایسته , امین میرشمسی کاخکی , محمد زارع مهرجردی , علیرضا سیفی ,
فایل: Full Text

استناددهی: BibTeX | EndNote

چکیده

گل جالیز گیاه انگلی است که باعث کاهش قابل توجهی در تولید محصولات زراعی می شود و کنترل آن نیز در شرایط مزرعه دشوار است. در این مطالعه تجزیه و تحلیل داده های RNA-seq موجود در NCBI، همراه با تایید آزمایشگاهی بخشی از نتایج حاصل گزارش می شود. پس از ارزیابی کیفیت خوانش های خام الومینا، خوانش های با کیفیت قابل قبول روی ترنسکرپتوم گل جالیز نقشه یابی شدند. پس از آنالیز بیان ژن با استفاده از نرم افزار DESeq، 391 ژن دارای بیان متفاوت در مرحله آبنوشی بذر گل جالیز و مرحل اتصال گل جالیز به ریشه میزبان شناسایی شد. بیان اورتولوگ این ژن ها در خویشاوندان نزدیک گل جالیز،که غیرانگل یا نیمه انگل هستند، نیز بررسی شد. از بین 391 ژنی که بین مرحله آبنوشی و اتصال به میزبان در گل جالیزتفاوت بیان معنی داری داشتند، 87 ژن در خویشاوند انگل گل جالیز نیز بیان بالایی در زمان اتصال به میزبان داشتند، در حالی که این ژن ها در خویشاوند غیر انگل بیان نمی شدند. بر این اساس این 87 ژن به عنوان ژن های کاندید دخیل در استقرار رابطه انگلی با میزبان در نظر گرفته شدند. در ادامه الگوی بیان نُه ژن از این ژن های کاندید انتخابی در بافت رویشی، گل، و بافت محل اتصال گل جالیز به گوجه فرنگی بررسی شد. نتایج نشان داد که ژن کدکننده سرین کربوکسی پپتیداز الگوی بیان مورد انتظار برای ژن های دخیل در ایجاد رابطه انگلی را دارد بنحوی که فقط در بافت محل اتصال به میزبان بیان می شود. نتایج این مطالعه می تواند برای اهداف مهندسی ژنتیک گوجه فرنگی برای ایجاد مقاومت به گل جالیزاز طریق خاموشی ژن در میزبان مورد استفاده قرار گیرد.

کلمات کلیدی

, سرین کربوکسی پپتیداز, افکتور, RNAi , هوستوریوم.
برای دانلود از شناسه و رمز عبور پرتال پویا استفاده کنید.

@article{paperid:1089478,
author = {دولت ابادی, راحیل and شایسته, هاجر and میرشمسی کاخکی, امین and محمد زارع مهرجردی and سیفی, علیرضا},
title = {شناسایی ژ نهای دخیل در استقرار رابطه انگلی در گ لجالیز مصری بر پایه تجزیه و تحلیل دادههای بیان ژ ن},
journal = {زیست فناوری گیاهان زراعی},
year = {2022},
volume = {10},
number = {4},
month = {April},
issn = {2252-0783},
pages = {37--46},
numpages = {9},
keywords = {سرین کربوکسی پپتیداز، افکتور، RNAi ، هوستوریوم.},
}

[Download]

%0 Journal Article
%T شناسایی ژ نهای دخیل در استقرار رابطه انگلی در گ لجالیز مصری بر پایه تجزیه و تحلیل دادههای بیان ژ ن
%A دولت ابادی, راحیل
%A شایسته, هاجر
%A میرشمسی کاخکی, امین
%A محمد زارع مهرجردی
%A سیفی, علیرضا
%J زیست فناوری گیاهان زراعی
%@ 2252-0783
%D 2022

[Download]