کاربرد زیست سامانه ها و بیوانفورماتیک در علوم زیستی , 2021-11-04

عنوان : ( شناسایی، طبقه بندی و بررسی بیان InSilico خانواده ژنی پلیآمین اکسیداز در سه گیاه انگل مدل از تیره گل جالیز )

نویسندگان: مجتبی لطفی , امین میرشمسی کاخکی ,

بر اساس تصمیم نویسنده مقاله دسترسی به متن کامل برای اعضای غیر دانشگاه ممکن نیست

استناددهی: BibTeX | EndNote

چکیده

گیاهان پارایت به دلیل خسارت زیادی که به محصولات کشاورزی وارد می کنند مورد توجه هستند و کنترل آنها مستلزم شناخت درست فرایند پارازیتیسم در آنها می باشد. در این پژوهش نقش احتمالی ژن های پلی آمین اکسیداز در فرایند پارازیتیسم سه گیاه پارازیت O. aegyptiaca، S. hermonthica و T. versicolor، بررسی شد. بدین منظور ابتدا با استفاده از تکنیک BLAST و الگوریتم HMMER هشت ژن پلی آمین اکسیداز در سه گیاه پارازیت شناسایی و وجود دومین آمین اکسیداز در پروتئین کد شده تأیید شد. سپس تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک انجام و هشت پروتئین شناسایی شده به همراه ارتولوگ های خود در گیاهان اربیدوپسیس، برنج، ذرت و پنبه در پنج کلاستر گروه بندی شدند. با توجه به اینکه پلی آمین اکسیدازهایی که در یک گروه قرار می گیرند عموماً دارای عملکرد مشابهی هستند؛ آنالیز فیلوژنتیک نشان داد که مکان فعالیت پروتئین های پلی آمین اکسیداز در گیاهان پارازیت احتمالا در پراکسی زوم و سیتوپلاسم می باشد. همچنین مشخص شد که از بین ژن های پلی آمین اکسیداز، دو ژن StHeBC3_19622.1 و StHeBC3_5232.9 در گونه S. hermonthica تفاوت بیان معنی داری در مراحل رشدی این گیاه دارند (۰۵/۰>p). پروفایل بیانی ژن ها نیز نشان داد که این دو ژن بیشترین بیان را در مرحله میانکنش S. hermonthica با گیاه میزبان دارند. در مجموع این مطالعه نشان داد که احتمالا ژن های پلی آمین اکسیداز در میانکنش گونه S. hermonthica با گیاه میزبان نقش مهمی دارند. تأیید مولکولی این نتایج می تواند مقدمه ای برای مطالعات بیشتر در زمینه میانکنش گیاهان پارازیت با گیاه میزبان باشد.

کلمات کلیدی

, گیاه انگل, کنترل علف هرز, پلی آمین اکسیداز
برای دانلود از شناسه و رمز عبور پرتال پویا استفاده کنید.

@inproceedings{paperid:1089530,
author = {لطفی, مجتبی and میرشمسی کاخکی, امین},
title = {شناسایی، طبقه بندی و بررسی بیان InSilico خانواده ژنی پلیآمین اکسیداز در سه گیاه انگل مدل از تیره گل جالیز},
booktitle = {کاربرد زیست سامانه ها و بیوانفورماتیک در علوم زیستی},
year = {2021},
location = {جیرفت, ايران},
keywords = {گیاه انگل، کنترل علف هرز، پلی آمین اکسیداز},
}

[Download]

%0 Conference Proceedings
%T شناسایی، طبقه بندی و بررسی بیان InSilico خانواده ژنی پلیآمین اکسیداز در سه گیاه انگل مدل از تیره گل جالیز
%A لطفی, مجتبی
%A میرشمسی کاخکی, امین
%J کاربرد زیست سامانه ها و بیوانفورماتیک در علوم زیستی
%D 2021

[Download]