عنوان : ( کاربرد تکنیک RFLP-PCR جهت تمایز بین ارقام نخود حساس و مقاوم به بیماری برق زدگی )
نویسندگان: کیانوش زنگنه , فرهاد شکوهی فر , مجتبی ممرآبادی ,
دانلود فایل برای اعضای دانشگاهبر اساس تصمیم نویسنده مقاله دسترسی به متن کامل برای اعضای غیر دانشگاه ممکن نیست
چکیده
بیماری برقزدگی یکی از مخربترین بیماریهای رایج کشت نخود در سراسر دنیا به شمار میرود این بیماری توسط قارچ بیماریزای Ascochyta rabiei ایجاد میگردد. یکی از موثرترین راههای مقابله با این بیماری استفاده از ارقام مقاوم است. اخیرا تعدادی از محققان چند شکلی های تک نوکلئوتیدی ) SNPs ( را در نواحی از ژنوم به طول تقریبی 100Kb بر روی کروموزوم شماره 4 نخود را شناسایی کردهاند که که در ایجاد مقاومت به بیماری برق زدگی نقش بسزایی دارد. در این پژوهش با استفاده از روشهای مولکولی و به کمک نرم افزارهای بیوانفورماتیکی شناسایی و تفکیک ارقام حساس از مقاوم نخود انجام شده است. برای یکی از نواحی معرفی شده یک جفت آغازگر طراحی گردید. انجام PCR با آغازگرهای طراحی شده از ناحیه SNP نشان داد قطعه مورد نظر در ارقام حساس و مقاوم به شکل یکسانی تکثیر شده اند. نتایج توالی یابی محصول PCR رقم مقاوم MCC133 و حساس ILC263 نشان داد که این ارقام درجایگاه 2757 ژن LOC101491667 در یک نوکلئوتید از قطعه خوانش شده با یکدیگر تفاوت دارند. بررسیهای تکمیلی با استفاده از نرم افزار Snap Gene نشان داد که آنزیم برشی MnlI در موقعیت SNP یافت شده جایگاه تشخیص برش دارد. به این معنی که در صورت عدم وجود SNP هضم آنزیمی انجام میشود و در صورت وجود SNP هضم آنزیمی انجام نخواهد شد. وب سایت آنلاین Restriction Analyzer نشان داد در اثر هضم آنزیمی محصول PCR رقم ILC263 هیچ برشی در طول قطعه حاصل نشد که نتیجه عدم حضور SNP در جایگاه مورد نظر و در نتیجه عدم برش است. اما در اثر هضم آنزیمی محصول PCR رقم MCC133 دوباند به طولهای 465bp و 172bp حاصل شد که نتیجه برش توسط آنزیم MnlI در جایگاه SNP ذکر شده است. از این رو آنزیم برشی MnlI قابلیت تفکیک و تمایز رقم حساس ILC263 از رقم مقاوم MCC133 با نمایش الگوی باندی متفاوت را دارد.
کلمات کلیدی
, آنزیم برشی, Ascochtya rabiei , مارکرمولکولی, ژن مقاومت
@inproceedings{paperid:1089732,
author = {زنگنه, کیانوش and شکوهی فر, فرهاد and ممرآبادی, مجتبی},
title = {کاربرد تکنیک RFLP-PCR جهت تمایز بین ارقام نخود حساس و مقاوم به بیماری برق زدگی},
booktitle = {ششمین کنفرانس بین المللی پژوهش های نوین در مهندسی کشاورزی، محیط زیست و منابع طبیعی},
year = {2022},
location = {ايران},
keywords = {آنزیم برشی، Ascochtya rabiei ، مارکرمولکولی، ژن مقاومت},
}
%0 Conference Proceedings
%T کاربرد تکنیک RFLP-PCR جهت تمایز بین ارقام نخود حساس و مقاوم به بیماری برق زدگی
%A زنگنه, کیانوش
%A شکوهی فر, فرهاد
%A ممرآبادی, مجتبی
%J ششمین کنفرانس بین المللی پژوهش های نوین در مهندسی کشاورزی، محیط زیست و منابع طبیعی
%D 2022
