عنوان : ( تحلیل تبارزائی دایه ایرانی ویروس نوار زرد ترهفرنگی از میزبان سیر براساس نواحی ژنومی CI و CP )
نویسندگان: آزاده انتظاری , محسن مهرور , محمد زکی عقل ,
دانلود فایل برای اعضای دانشگاهبر اساس تصمیم نویسنده مقاله دسترسی به متن کامل برای اعضای غیر دانشگاه ممکن نیست
چکیده
ویروس نوار زرد ترهفرنگی (LYSV- virus stripe yellow Leek )متعلق به جنس Potyvirus و خانواده Potyviridae ،به عنوان یکی از بیمارگرهای غالب و مهم با بیماریزایی باال در میزبان سیر معرفی شده است. در این مطالعه به منظور شناسایی LYSV ،نمونهبرداری از استان خوزستان، شهرستان شوشتر انجام شد. بدین منظور تعداد 22 نمونه برگی سیر با عالئم کلروز نواری، موزائیک و بدشکلی جمعآوری شد. بررسی اولیه آلودگی با استفاده از آغازگرهای عمومی پوتیویروسی مربوط به هر یک از نواحی ژنی CI( Inclusion Cylindrical )و NIb( body Inclusion Nuclear )با استفاده از آزمون PCR-RT صورت گرفت. الکتروفورز محصول PCR بر روی ژل آگارز 1 %به ترتیب وجود قطعاتی به طول 011 و 351 جفت بازی را در 15 نمونه از میان 22 نمونه جمعآوری شده نشان داد. اما نتایج حاصل از تعیین توالی نوکلئوتیدی، صرفا آلودگی سه نمونه از میان 15 نمونه به LYSV را تأیید نمود. جهت تکمیل بررسیها، جدایهای با نام AE65-LYSV انتخاب و با استفاده از دو جفت آغازگر اختصاصی مربوط به توالی کامل ژنهای CI و CP( Protein Coat )مورد بررسی قرار گرفت. محصول PCR مربوط به هر قطعه ژنومی پس از همسانهسازی در حامل پالسمیدی T-pTG19، توالییابی شد. نتایج حاصل از بررسی تبارزائی بر اساس ترادف نوکلئوتیدی هریک از ژنهای CI و CP ،ارتباط روشنی بین گروهبندی تبارزائی با منشاء جغرافیـایی و میزبانی را نشان نداد. در بررسی وقوع نوترکیبی در این جدایه با استفاده از برنامه RDP4 هیچ نوترکیبی در این نواحی مشاهده نشد. این مطالعه اولین بررسی مولکولی LYSV در ایران میباشد.
کلمات کلیدی
, سیر, آنالیز فیلوژنتیکی, نوترکیبی, LYSV , PCR-R
@article{paperid:1092188,
author = {انتظاری, آزاده and مهرور, محسن and زکی عقل, محمد},
title = {تحلیل تبارزائی دایه ایرانی ویروس نوار زرد ترهفرنگی از میزبان سیر براساس نواحی ژنومی CI و CP},
journal = {پژوهش های کاربردی در گیاه پزشکی},
year = {2021},
month = {September},
issn = {2383-1855},
keywords = {سیر، آنالیز فیلوژنتیکی، نوترکیبی، LYSV ،PCR-R},
}
%0 Journal Article
%T تحلیل تبارزائی دایه ایرانی ویروس نوار زرد ترهفرنگی از میزبان سیر براساس نواحی ژنومی CI و CP
%A انتظاری, آزاده
%A مهرور, محسن
%A زکی عقل, محمد
%J پژوهش های کاربردی در گیاه پزشکی
%@ 2383-1855
%D 2021
