عنوان : ( مقایسه تنوع ژنتیکی ناحیه 3′UTR جدایههای ویروس سوختگی سیاه برگ چغندرقند (Beet black scorch virus) خراسان با جدایههای ایران و سایر نقاط دنیا )
نویسندگان: جمشیدسلطانی ایدلیکی , محسن مهرور , محمد زکی عقل ,
دانلود فایل برای اعضای دانشگاهبر اساس تصمیم نویسنده مقاله دسترسی به متن کامل برای اعضای غیر دانشگاه ممکن نیست
چکیده
ویروس سوختگی سیاه برگ چغندرقند )BBSV, virus scorch black Beet )ازجمله ویروسهای خاکبرد چغندرقند است. در این تحقیق، 05 نمونه چغندرقند از مزارع خراسان رضوی و شمالی جمعآوری شد. پس از استخراج RNAی کل آنها، ناحیه UTR\\\\\\\'3 ژنوم ویروس به تعداد 310 نوکلئوتید با استفاده از واکنش زنجیرهای پلیمراز با رونویسی معکوس و بهرهگیری از آغازگرهای اختصاصی رفت و برگشتی تکثیر شد. این ناحیه در شش جدایه مختلف پس از همسانه سازی، توالییابی و در NCBI ثبت شدند. نتایج بررسی خویشاوندی این جدایهها )بر اساس UTR\\\\\\\'3 (با کل جدایههای ثبتشده در بانک جهانی نشان داد که آنها در دو گروه عمده I و II قرار میگیرند بهطوریکه هر یک به دو زیرگروه تقسیم میشوند. شش جدایه این بررسی با 23 جدایه از نقاط مختلف ایران در زیرگروه IA و چهار جدایه دیگر از خراسان در زیرگروه IB جای گرفتند. سه جدایه از کرمانشاه و یک جدایه از همدان )-Ir Ir-KSh9,Ir-KSh8,Ir- کرمانشاه از جدایه چهار. گرفتند قرار IIA زیرگروه در( Ir-Ha2 و KSh5,Ir-KSh4 Ir-KSh6 (KSh7 و KSh10-Ir )به همراه جدایههای چینی، اروپایی و آمریکایی زیرگروه IIB را تشکیل دادند. نتایج مقایسه نوکلئوتیدی توالی شش جدایه نشان داد که اگرچه تغییر نوکلئوتیدی مهم در موقعیت 3033( یوریدین بجای گوانین( صورت نگرفته است، اما در موقعیت 3310 آدنین جایگزین گوانین و در موقعیت 3313 فقط در جدایه فریمان )MW274750 )یوریدین بجای سیتوزین جایگزین شده است. نتایج مقایسه میانگین شباهت نوکلئوتیدی ناحیه UTR\\\\\\\'3 این جدایهها نشان داد که با جدایههای ایرانی )به غیر از جدایه- های کرمانشاه با 02/12 درصد( در دامنه بین 30/10-33/13 درصد مشابهت دارند.
کلمات کلیدی
, بیماریهای چغندرقند, توالی یابی, ویروسهای گیاهی.
@article{paperid:1092191,
author = {جمشیدسلطانی ایدلیکی and مهرور, محسن and زکی عقل, محمد},
title = {مقایسه تنوع ژنتیکی ناحیه 3′UTR جدایههای ویروس سوختگی سیاه برگ چغندرقند (Beet black scorch virus) خراسان با جدایههای ایران و سایر نقاط دنیا},
journal = {دانش گیاه پزشکی ایران},
year = {2022},
volume = {52},
number = {2},
month = {January},
issn = {2008-4781},
pages = {135--147},
numpages = {12},
keywords = {بیماریهای چغندرقند، توالی یابی، ویروسهای گیاهی.},
}
%0 Journal Article
%T مقایسه تنوع ژنتیکی ناحیه 3′UTR جدایههای ویروس سوختگی سیاه برگ چغندرقند (Beet black scorch virus) خراسان با جدایههای ایران و سایر نقاط دنیا
%A جمشیدسلطانی ایدلیکی
%A مهرور, محسن
%A زکی عقل, محمد
%J دانش گیاه پزشکی ایران
%@ 2008-4781
%D 2022
