ترشح پروتئین های اثر گذار توسط قارچ می تواند در مهار سیستم های دفاعی گیاه نقش داشته باشد و لذا شناسائی ژن های کدکننده آن می تواند در شناسائی منابع مقاومت و طراحی برنامه های اصلاحی مورد استفاده قرار گیرد. قارچ نکروتروف Ascochyta rabiei از جمله بیمارگرهای خسارت زا روی گیاه نخود به شمار می رود. داده های ژنومی و ترانسکریپتومی این قارچ در شرایط برهمکنش با گیاه شرایط مناسبی را برای شناسائی ژن های بیماریزا و اثرگذار در این قارچ مهیا نموده است. مطالعه حاضر با هدف ردیابی ژن اثرگذار GSH301 به عنوان یکی از ژن های کاندیدا در ژنوم و ترانسکریپتوم پاتوتایپ های این قارچ انجام گرفت. توالی ژن GSH301 براساس داده ها موجود در NCBI استحصال شد و طی آنالیز های بیوانفورماتیک حضور خصوصیات پروتئین های اثرگذار مانند توالی سیگنال پپتیدی، دمین های گذرنده از غشاء، تعداد و موقعیت اسیدآمینه سیستئین و باندهای دی سولفیدی پیش بینی و ساختار سه بعدی روی پروتیئین مربوط به این ژن مورد بررسی قرار گرفت. جهت ردیابی این ژن، پرایمرهای اختصاصی PSH301-F/R براساس مناطق بالادست و پائین دست آن طراحی گردید. نتایج الگوی الکتروفورزی محصول PCR، تکثیر تک باند اختصاصی به طول 379 جفت باز را در هر سه پاتوتیپ مورد مطالعه تایید نمود. هرچند بیان ژن حیاتی GAPDH در سطح ترانسکریپتوم میسلیوم های رشد یافته قارچ در شرایط محیط کشت تایید شد ولی ردیابی ترانسکریپت ژن GSH301 ممکن نشد.

کلمات کلیدی