گیاه نخود با نام علمی .Cicer arietinum L یکی از ارزشمندترین حبوبات در دنیا از نظر اهمیت غذایی می باشد. مهمترین بیماری این گیاه برق زدگی (Ascochyta blight) است که عامل آن پاتوژن قارچی Ascochyta rabiei می باشد. شناسائی ژن های اثر گذار در درک بهتر سازوکار بیماریزایی قارچ و نحوه برهمکنش آن با گیاه تاثیر به سزایی دارد. تاکنون ژن های اثرگذار مختلفی بیمارگرهای گیاهی شناسائی شده است. یکی از روش های شناسائی این ژن ها در بیمارگرها، جستجوی توالی همولوگ های شناخته شده آنها می باشد. پروتئین ECP6 یکی از پروتئین های اثر گذار حامل چند دمین LysM است که قادر است الیگومرهای کیتین آزاد شده از قارچ را مهار نماید و در نتیجه از فعال شدن گیرنده های کیتین در سطح سلول های گیاهی ممانعت می کند. هدف این مطالعه ردیابی همولوگ های ECP6 در داده های ژنومی قارچ A. rabiei می باشد. بدین منظور جستجوی توالی پروتئین ECP6 در داده های ژنومی قارچ A. rabiei انجام شد. در نتایج حاصل سه کاندیدا مشاهده شد که بر اساس ویژگی های حضور دمین LysM، وجود سیگنال پپتید، غنی بودن از سیستئین و قابلیت تشکیل باندهای دی سولفیدی تنها یک توالی کدکننده انتخاب و ArLysM1 نامگذاری شد. این ژن کاندیدا با دو منطقه اگزونی پروتئینی به طول 217 اسید آمینه را کد می کند که سه دمین LysM روی اگزون دوم قرار گرفته اند.

کلمات کلیدی