عنوان : ( مقایسه روش های HRM و DGGE جهت بررسی ترکیب جوامع باکتریایی خاک در کاربری های اراضی مختلف )
نویسندگان: قباد جلالی , امیر لکزیان , علیرضا آستارائی , محبوبه مظهری ,چکیده
تغییر کاربری اراضی یکی از مهمترین فاکتورهایی است که جوامع ریزجانداران خاک را تحت تأثیر قرار داده که نقش محوری در اکثر فرایندهای بیوژئوشیمیایی و اکولوژیکی ایفا میکنند. بهمنظور بررسی تأثیر تغییر کاربری اراضی (از مراتع بوتهزار به کشاورزی) روی ترکیب جوامع باکتریایی خاک، مطالعهای با استفاده از آنالیز تفکیکپذیری بالای ذوب (HRM) و روش ژل الکتروفورز با شیب واسرشتساز (DGGE) در سه کاربری اراضی باغی، زراعی و مرتع بوتهزار در دشت جیرفت انجام شد. برای آنالیز HRM از نرمافزار جانبی دستگاه Real-time PCR که مجهز به این تکنیک است، استفاده شد. DGGE با استفاده از سیستم جهانی تشخیص جهش انجام شد. نتایج تکنیک HRM و همپنین نتایج رجبندی با استفاده از روش مقیاسبندی چند بعدی غیرمتریک (NMDS) و بر پایه حضور یا عدم حضور باندهای DGGE در نمونههای خاک نشان دادند که تغییر کاربری اراضی از مراتع بوتهزار به کشاورزی (باغ و زراعی) سبب تغییر معنیدار در ترکیب جوامع باکتریایی خاک شده است. همچنین با توجه به نتایج هر دو روش، ترکیب جوامع باکتریایی خاک در کاربریهای اراضی کشاورزی (باغ و زراعی) نسبت به کاربری مرتع بوتهزار دارای شباهت بیشتری بود. از آنجایی که آنالیز HRM در مقایسه با تکنیک DGGE کم هزینهتر، راحتتر و دارای انحراف کمتر میباشد، جهت مقایسه ترکیب جوامع باکتریایی خاک بین نمونههای مختلف پیشنهاد میشود.
کلمات کلیدی
, DNA ژنومی خاک 16S rDNA باکتریایی خاک Real, time PCR مقیاسبندی چند بعدی غیرمتریک (NMDS)@article{paperid:1097549,
author = {جلالی, قباد and لکزیان, امیر and آستارائی, علیرضا and محبوبه مظهری},
title = {مقایسه روش های HRM و DGGE جهت بررسی ترکیب جوامع باکتریایی خاک در کاربری های اراضی مختلف},
journal = {زیست شناسی خاک},
year = {2022},
month = {February},
issn = {2345-2536},
keywords = {DNA ژنومی خاک 16S rDNA باکتریایی خاک Real-time PCR مقیاسبندی چند بعدی غیرمتریک (NMDS)},
}
%0 Journal Article
%T مقایسه روش های HRM و DGGE جهت بررسی ترکیب جوامع باکتریایی خاک در کاربری های اراضی مختلف
%A جلالی, قباد
%A لکزیان, امیر
%A آستارائی, علیرضا
%A محبوبه مظهری
%J زیست شناسی خاک
%@ 2345-2536
%D 2022