Les micro-organismes sont des acteurs majeurs dans le cycle biogéochimique du Carbone (photosynthèse et respiration). Les sols froids, notamment les artico-alpins, stockent prés de 20% du Carbone organique des sols. Dans le cadre du réchauffement climatique, il est question du comportement de ses sols vis-à-vis du cycle de Carbone est sont des alpins stockent, notamment en ce qui concerne le comportement puits vs source. Etant donné le rôle des bactéries dans le dégagement du CO2 (biominéralisation de C), les études sur les bactéries du sol sont pertinents. Ce travail a eu pour objective la caractérisation des bactéries cultivables de deux écosystèmes alpins pouvant se comporter comme source (combes de neige) ou puits (crêtes). Le site d’étude est localisé dans le massif du Grand Galibier. Nous avons prélevé des sols le mois d’octobre 2005 et 2006. L’isolement des bactéries cultivables a été effectué sur différentes sources de carbone et différentes températures (25°C et 4°C). Des dénombrements au DAPI et CFU montrent que les crêtes sont plus riches en bactéries que les combes. Nous avons sélectionné 89 souches, pour le séquençage du gène de l’ARN 16S. L’étude de ces séquences (BLAST, RDPII, MEGA3) a mis en évidence une richesse en espèces plus grande en combes qu’en crête, ainsi que des espèces caractéristiques de chaque écosystème. Enfin, une grande partie des bactéries en crête et en combe sont des actinomycètes et des CFB, connus pour dégrader la matière organique complexe. Ce dernier résultat permet de relier la diversité bactérienne avec les conditionnes biotiques et abiotique de ces écosystème. L’étude moléculaire des communautés bactériennes est en cours.

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