عنوان : ( صحت ارزشهای ژنومی پیش بینی شده با استفاده از تابعیت مولفه های اصلی به روش بیزی )
نویسندگان: سیدمهدی حسینی وردنجانی , محمد مهدی شریعتی ,
چکیده
حساسیت مدلهای آماری پیش بینی ژنومی به انتخاب پرایور مناسب برای پارامترهای کلیدی به خوبی اثبات شده است. واریانس در رگرسیون مؤلفههای اصلی (PCR) یک کمیّت ثابت تلقی شده و به طور مساوی و یا متناسب با مقادیر ویژه به هر PC اختصاص داده میشود. در این مطالعه واریانس با اختصاص توزیع پیشین تصادفی تلقی شد و روشی جدید برای تعیین واریانس PCs ارائه شد. صفتی با وراثت پذیری 25/0 بر روی ژنومی دارای سه کروموزوم با SNP3000 و QTL 60 شبیه سازی شد. سه توزیع مختلف شامل نرمال، t مقیاس شده و نمایی مضاعف برای PC اسکورها و توزیع کای اسکویر معکوس مقیاس شده برای واریانسها در نظر گرفته شد. همچنین PCR با واریانس متناسب با مقادیر ویژه (PCR-Eigen) و روشهای بیز ریدج (BRR)، بیز A (BA) و بیز B (BB) نیز بررسی شدند. نتایج نشان داد که ضرایب همبستگی پیرسون و رتبهای بین ارزشهای اصلاحی واقعی و ژنومی پیش بینی شده با استفاده از توزیعهای پیشین مختلف به ترتیب 2/3-3/2 و 9/2-7/2 درصد بالاتر از PCR-Eigen است. صحّت پیش بینیها با اختصاص توزیع پیشین به پارامترها مشابه روشهای BR، BA و BB بود ولی با PCR-Eigen حداقل 3/3 درصد پایینتر بود. PCR-Eigen به صورت ترتیبی به چند PC اول وزن بیشتری داد و PCs بعدتر وزنی تقریباً معادل صفر داشتند در حالیکه با اختصاص توزیع پیشین به پارامترها، به مجموعهی PCهای اول وزن بیشتری داده شد و وزن PCs بعدتر نیز هنوز قابل توجّه بود.
کلمات کلیدی
, انتخاب ژنومی, مدلهای آماری, توزیع پیشین, مقادیر ویژه@inproceedings{paperid:1062880,
author = {حسینی وردنجانی, سیدمهدی and شریعتی, محمد مهدی},
title = {صحت ارزشهای ژنومی پیش بینی شده با استفاده از تابعیت مولفه های اصلی به روش بیزی},
booktitle = {هفتمین کنگره علوم دامی ایران},
year = {2016},
location = {کرج, ايران},
keywords = {انتخاب ژنومی- مدلهای آماری- توزیع پیشین- مقادیر ویژه},
}
%0 Conference Proceedings
%T صحت ارزشهای ژنومی پیش بینی شده با استفاده از تابعیت مولفه های اصلی به روش بیزی
%A حسینی وردنجانی, سیدمهدی
%A شریعتی, محمد مهدی
%J هفتمین کنگره علوم دامی ایران
%D 2016