هشتمین همایش علوم و علف های هرز ایران , 2019-08-27

عنوان : ( جداسازی و بررسی In silico نقش ژن کاندید در میانکنش میزبان- گل جالیز (Phelipanche aegyptiaca) )

نویسندگان: محمدرضا رضائی , امین میرشمسی کاخکی , علیرضا سیفی ,
فایل: Full Text

استناددهی: BibTeX | EndNote

چکیده

گونه‌های گل جالیز (Orobanche spp)، انگل مطلق ریشه، گل دهنده و عاری از کلروفیل هستند، که با اتصال به ریشه میزبان، خسارت جبران ناپذیری به گیاه وارد می کنند. در این بین، گل جالیز مصری (P. aegyptiaca) یکی از مهمترین گونه‌های گل جالیز می‌باشد که خسارت پنهان آن به انواع گیاهان زراعی، بسیار قابل توجه و گاهی جبران ناپذیر است. با توجه به اهمیت مطالعه جنبه های مولکولی میانکنش انگل- میزبان و روشن شدن مکانیسم های مولکولی کلیدی این میانکنش داده های RNA-Seq موجود آنالیز شد. نتایج تجزیه و تحلیل ترنسکریپتوم، منجر به شناسایی 24 ژن احتمالی با تغییرات بیان معنی دار در مقایسه با مرحله جوانه زنی (G0) و استقرار (G3) گردید. از بین ژنهای شناسایی شده احتمالی یک رونوشت ژن با کارکرد نامشخص و همراه با سطح بیان بالا در تجزیه و تحلیل RNA-Seq شناسایی گردید. برای تشخیص نقش احتمالی این رونوشت در فرایند انگلی شدن گل جالیز، توالی کامل آن با استفاده از روش پیمایش ژنومی به دست آمد. تجزیه تحلیل بیوانفورماتیکی این توالی کامل، دامین های ترنسپوزاز و Zinc finger را نشان داد که احتمالا نقش تنظیمی در فرایند انگلی شدن دارند.

کلمات کلیدی

, پیمایش ژنوم, ترنسکریپتوم, گل جالیز
برای دانلود از شناسه و رمز عبور پرتال پویا استفاده کنید.

@inproceedings{paperid:1076306,
author = {رضائی, محمدرضا and میرشمسی کاخکی, امین and سیفی, علیرضا},
title = {جداسازی و بررسی In silico نقش ژن کاندید در میانکنش میزبان- گل جالیز (Phelipanche aegyptiaca)},
booktitle = {هشتمین همایش علوم و علف های هرز ایران},
year = {2019},
location = {مشهد, ايران},
keywords = {پیمایش ژنوم، ترنسکریپتوم، گل جالیز},
}

[Download]

%0 Conference Proceedings
%T جداسازی و بررسی In silico نقش ژن کاندید در میانکنش میزبان- گل جالیز (Phelipanche aegyptiaca)
%A رضائی, محمدرضا
%A میرشمسی کاخکی, امین
%A سیفی, علیرضا
%J هشتمین همایش علوم و علف های هرز ایران
%D 2019

[Download]