؟ , 2007-02-06

Title : Influence of Data Structure on Estimates of Maternal Parameters ( Influence of Data Structure on Estimates of Maternal Parameters (تاثیر ساختار ژنتیکی جمعیت برروی برآورد پارامترهای مربوط به صفات تحت تاثیر اثرات مادری) )

Authors: Mahyar Heydarpour , Larry Schaeffer ,

Citation: BibTeX | EndNote

Abstract

The estimation of (co)variance components for multiple traits with maternal genetic effects was found to be influenced by population structure. Two traits in a closed breeding herd with random mating were simulated over nine generations. Population structures were simulated on the basis of different proportions of dams not having performance records (0, 0.1, 0.5, 0.8, and 0.9); three genetic correlations (-0.5, 0.0, +0.5) between direct and maternal effects; and three genetic correlations (0, 0.3, 0.8) between two traits. Three ratios of direct to maternal genetic variances, (1:3, 1:1, 3:1), were also considered. Variance components were estimated by REML using DMU software. The proportion of dams without records had an effect on the SE of direct-maternal covariance estimates when the proportion was 0.8 or 0.9 and the true correlation between direct and maternal effects was negative. The ratio of direct to maternal genetic variances influenced the SE of the (co)variance estimates more than the proportion of dams with missing records. The correlation between two traits did not have an effect on SE of the estimates. The proportion of dams without records and the correlation between direct and maternal effects had stronger effects on bias of estimates. The largest biases were obtained when the proportion of dams without records was high, the correlation between direct and maternal effects was positive, and the direct variance was greater than the maternal variance, as would be the situation for most growth traits in livestock. Total bias in all parameter estimates for two traits was large in the same situations. Poor population structure can affect both bias and SE of estimates of the direct-maternal genetic correlation, and can explain some of the large negative estimates often obtained. تاثیر ساختار ژنتیکی جمعیت بر روی برآورد اجزای واریانس صفات تحت کنترل اثرات مادری با استفاده از یک مدل شبیه سازی مورد مطالعه قرار گرفت. در این مدل تعداد 400 حیوان ماده و 50 حیوان نر بعنوان جامعه پایه انتخاب گردیدند وآمیزش تصادفی بین این حیوانات در طول 9 نسل صورت گرفت. تعداد پنج جامعه مختلف براساس تعداد ویا نسبت فراوانی مادرهایی که دارای رکورد بودند طراحی گردید و بدین منظور هر جامعه دارای درصد خاصی از مادرها بود که دارای رکورد تولید بودند (100%, 90%, 50%, 20%, و 10%). برای همبستگی ژنتیکی بین اثرات ژنتیکی افزایشی مادری و اثرات محیطی نیز سه مقدار 0.5- , 0.0 , و 0.5+ مفروض گردید. سه کمیت برای همبستگی ژنتیکی بین دو صفت مورد مطالعه نیزمشخص گردید که عبارت بودند از 0.0 , 0.3 , و 0.8. نسبتهای متفاوت بین واریانس های ژنتیکی افزایشی مستقیم و واریانس ژنتیکی اثرمادری نیزمورد ارزیابی قرار گرفت (3:1 , 1:1 , و 1:3). واریانس ها و کوواریانس های ژنتیکی توسط روش حداکثر درستنمایی محدود شده (REML ) بکمک برنامه آماری DMUمحاسبه گردیدند. نتایج بدست آمده از محاسبات نشان داد که درصد مادرهای دارای رکورد تولید اثرچندانی برروی میزان خطای استاندارد ( SE ) واریانسهای ژنتیکی افزایشی اثرمادری , واریانس محیط دایمی مادر و کوواریانس ژنتیکی اثرافزایشی و محیطی نداشته است ولی در مورد واریانس ژنتیکی افزایشی مستقیم بالاترین میزان خطای استاندارد زمانی بدست آمد که درصد رکوردهای تولیدی مادردر کمترین مقدارخود قرارداشت (0.8 یا 0.9) و همبستگی ژنتیکی بین واریانس ژنتیکی افزایشی مستقیم و واریانس ژنتیکی افزایشی مادری منفی بود (0.5- = r). تاثیرنسبتهای متفاوت بین واریانسهای ژنتیکی برروی برآورد واریانس خطای استاندارد ( SE ) بمراتب بیشترازاثردرصد مادرهای دارای رکورد مشاهده شد . همبستگی ژنتیکی بین دو صفت هیچگونه اثرمعنی داری برروی واریانس خطای بدست آمده نداشت . اثرفاکتور درصدهای متفاوت مادرهای دارای رکورد تولید و همچنین اثرفاکتور همبستگی ژنتیکی بین واریانس ژنتیکی افزایشی مستقیم و مادری بر روی مقدار اریبی (bias) برآوردها بمراتب بیشتر از اثرفاکتورنسبت های متفاوت واریانسهای ژنتیکی و همبستگی ژنتیکی بین دوصفت بود. بیشترین مقداراریبی برآوردها زمانی بدست آمد که درصد مادرهای دارای رکورد درجامعه بسیارکم (10%) و همبستگی ژنتیکی بین واریانس ژنتیکی افزایشی مستقیم و مادری نیزمثبت بود(5/0r = ). درحالتی که واریانس واقعی ژنتیکی افزایشی مستقیم ازواریانس واقعی ژنتیکی افزایشی مادری بزرگتر بود , این اریبی درمقداربرآوردها بیشترمشاهده گردید که این حالت تقریبا در اکثر صفات مربوط به رشد درحیوانات بخصوص درگاوگوشتی بچشم میخورد. بیشترین درصد مقداراریبی کل برآوردها درکل سیستم برآورد پارامترها زمانی بدست آمد که تعداد مادرهای دارای رکورد درحد بسیارکم (0.9) و همبستگی ژنتیکی مثبت و نسبت بین واریانسهای ژنتیکی افزایشی مستقیم و مادری مساوی بود (1:1). نتایج این تحقیق بطور کلی نشان داد که تعداد رکوردهای مادری و همبستگی ژنتیکی بین واریانس ژنتیکی افزایشی مستقیم و مادری بیشترین اثررا برروی اریبی برآوردهای مربوط به صفات مادری داراست. برای برآورد دقیق پارامترهای ژنتیکی صفات دارای اثرمادری وجود اطلاعات مربوط به رکوردهای مادروهمچنین ارتباطات بین مادرو فرزندان در فایل شجره بسیار ضروری میباشد

Keywords

Influence of Data Structure on Estimates of Maternal Parameters (تاثیر ساختار ژنتیکی جمعیت برروی برآورد پارامترهای مربوط به صفات تحت تاثیر اثرات مادری)
برای دانلود از شناسه و رمز عبور پرتال پویا استفاده کنید.

@inproceedings{paperid:516,
author = {Heydarpour, Mahyar and Larry Schaeffer},
title = {Influence of Data Structure on Estimates of Maternal Parameters},
booktitle = {؟},
year = {2007},
keywords = {Influence of Data Structure on Estimates of Maternal Parameters (تاثیر ساختار ژنتیکی جمعیت برروی برآورد پارامترهای مربوط به صفات تحت تاثیر اثرات مادری)},
}

[Download]

%0 Conference Proceedings
%T Influence of Data Structure on Estimates of Maternal Parameters
%A Heydarpour, Mahyar
%A Larry Schaeffer
%J ؟
%D 2007

[Download]